More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2740 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2740  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2222  ABC transporter related  55.21 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1827  ABC transporter related protein  52.31 
 
 		 272 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1427  ABC transporter related  50.95 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0305072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  40.32 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  42.17 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.76 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  39.76 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.72 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.72 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.758275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  36.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 539 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.77 
 
 		 298 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  43.1 
 
 		 577 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1067  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 385 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  40.25 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  37.16 
 
 		 541 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.08 
 
 		 322 aa  161  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 587 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1950  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4448  ABC transporter related  36.5 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2191  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 334 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.62 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  39.06 
 
 		 551 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  39.83 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  39.76 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  36.56 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 		 329 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  36.82 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2159  oligopeptide transport ATP-binding protein  36 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00546678  normal  0.0666705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1956  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  36 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  42.06 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2066  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.24 
 
 		 612 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  42.06 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 623 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 623 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 633 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 		 680 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  39.24 
 
 		 612 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 623 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 623 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.87 
 
 		 566 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  41.63 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  41.63 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  41.63 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 		 342 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  40.71 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 623 aa  158  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 333 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.787824  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0222  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 336 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0235  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 336 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  38.2 
 
 		 551 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 623 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  36.12 
 
 		 610 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0235  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 		 561 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 		 388 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.04 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  40.43 
 
 		 556 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.22 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00548391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1893  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  38.22 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.854707  normal  0.049175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  37.84 
 
 		 606 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  36.84 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1733  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  38.22 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.018169  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2794  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 323 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0190299  normal  0.692526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>