More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1864 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  88.02 
 
 		 242 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  75.78 
 
 		 246 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  70.05 
 
 		 233 aa  287  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 264 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  68.58 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  69.12 
 
 		 233 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  68.66 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  69.12 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  68.14 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  69.12 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  69.12 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  68.66 
 
 		 266 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  58.45 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  58.45 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  47.4 
 
 		 192 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  41.94 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  32.54 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.02 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  37.02 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.02 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.02 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.02 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.02 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.02 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.59 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  41.24 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  35.96 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.31 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.78 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.9 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  37.36 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  31.84 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.11 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  31.84 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  29.69 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  36.06 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.75 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  28.82 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  40.43 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.45 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  35.24 
 
 		 360 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.78 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 		 362 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  34.5 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  39.8 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  38.86 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  35.12 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  30.85 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  33.5 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  29.17 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  34.45 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.16 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  37.74 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000942393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38.31 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  35.74 
 
 		 364 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  33.19 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  34.63 
 
 		 361 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1262  ABC transporter-like  34.59 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  27.5 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  36.06 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.56 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  27.32 
 
 		 376 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  36.41 
 
 		 337 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 		 365 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  33.92 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  35.27 
 
 		 343 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  30.3 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  29.54 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0592  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  37.19 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  34.53 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  32.9 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.870147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>