More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2322 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
242 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  88.02 
 
 
242 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  74.21 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
276 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
264 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
231 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
231 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
231 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  66.96 
 
 
231 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  66.52 
 
 
231 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  65.22 
 
 
276 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  66.37 
 
 
233 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  67.74 
 
 
233 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  67.74 
 
 
233 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  67.74 
 
 
233 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  66.36 
 
 
233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  66.97 
 
 
233 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  66.52 
 
 
266 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  57.8 
 
 
224 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  56.88 
 
 
230 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  57.34 
 
 
224 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 
192 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  42.86 
 
 
221 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.04 
 
 
225 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  28.87 
 
 
244 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.41 
 
 
225 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.41 
 
 
225 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.46 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.41 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  36.46 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.41 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.46 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.87 
 
 
225 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.91 
 
 
225 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  36.54 
 
 
241 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  40.89 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  37.36 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.25 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  40.57 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  35.64 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.67 
 
 
244 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
255 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.23 
 
 
220 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.1 
 
 
240 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.23 
 
 
220 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  36.45 
 
 
225 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.09 
 
 
240 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  35.45 
 
 
243 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  35.82 
 
 
256 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.54 
 
 
362 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 
216 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  31.19 
 
 
352 aa  105  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
222 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.51 
 
 
216 aa  105  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1431  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  29.65 
 
 
256 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.38 
 
 
233 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 
247 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
272 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  34.5 
 
 
277 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  31.9 
 
 
248 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  29.03 
 
 
231 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
253 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000942393  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  32.91 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 
279 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  37.18 
 
 
251 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  30.63 
 
 
251 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  36.61 
 
 
254 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  38.51 
 
 
213 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
286 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  37.38 
 
 
364 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  38.89 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.31 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0550  phosphate transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
266 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0359987  hitchhiker  1.46306e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 
287 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  38.3 
 
 
212 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  33.77 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1262  ABC transporter-like  36.42 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.62 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  35.18 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  28.11 
 
 
231 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0592  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  37.5 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  35 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>