More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1436 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  44.39 
 
 		 246 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  41.94 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  45.36 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  42.78 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  42.78 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  41.79 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  44.38 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  43.82 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  42.78 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  42.78 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.5 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  30.63 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  33.85 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  31.75 
 
 		 352 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  35.11 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  32.51 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  38.14 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  35.65 
 
 		 295 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  34.38 
 
 		 536 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  31.34 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.33 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  33.18 
 
 		 352 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  33.7 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  33.8 
 
 		 362 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  35 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  29.06 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  27 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  32.85 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.61 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  33.17 
 
 		 340 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.02 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 381 aa  98.6  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  33.03 
 
 		 250 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.02 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.02 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  35.35 
 
 		 266 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.02 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.02 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  30.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  30.64 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  31.28 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  30.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  35.21 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.58 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.58 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0852  ABC transporter related  33.64 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327351  hitchhiker  0.00847775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 357 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.07 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.07 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0283  ABC transporter related  34.65 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  33.33 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  33.99 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  29.68 
 
 		 358 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  31.82 
 
 		 357 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 		 349 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  32.11 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 354 aa  95.5  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  29.28 
 
 		 248 aa  95.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  33.93 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  35.68 
 
 		 261 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  36.49 
 
 		 263 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1172  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 269 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193419  normal  0.054455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  35.03 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 257 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1760  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  37.14 
 
 		 369 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  29.28 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  29.46 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  29.22 
 
 		 359 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  33.77 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  36.41 
 
 		 263 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.1 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  34.1 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  33.64 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  34.33 
 
 		 356 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  33.64 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  33.33 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>