More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5071 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
233 aa  460  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  93.13 
 
 
233 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  93.13 
 
 
233 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  91.42 
 
 
233 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  90.13 
 
 
233 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  89.27 
 
 
266 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  86.7 
 
 
233 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  78.26 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  76.62 
 
 
231 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 
231 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 
231 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  78.03 
 
 
276 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 
231 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 
264 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 
231 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  70.54 
 
 
246 aa  297  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  70.05 
 
 
242 aa  287  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  66.37 
 
 
242 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  56.7 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  58.72 
 
 
224 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  58.26 
 
 
224 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  44.27 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  41.79 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.18 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
220 aa  118  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  44.44 
 
 
226 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  37.93 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38.5 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  33.02 
 
 
220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  33.02 
 
 
220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  35.19 
 
 
213 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.71 
 
 
225 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.58 
 
 
212 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
215 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.27 
 
 
225 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.27 
 
 
225 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.27 
 
 
225 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.27 
 
 
225 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.24 
 
 
225 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.78 
 
 
225 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
246 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
222 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  36.67 
 
 
251 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  35 
 
 
202 aa  99  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  35 
 
 
222 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  39.07 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.86 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.37 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  32.73 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.54 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  38.24 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.25 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  34.25 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.25 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.25 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  33.99 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 
362 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  34.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.92 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.25 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  39.71 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  37.88 
 
 
197 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  34.76 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2696  ABC transporter related  33.01 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  28.77 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0020  ABC-type sugar transport system, ATPase component  31.2 
 
 
373 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  30.84 
 
 
259 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  35.29 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.52 
 
 
254 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.08 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  30.69 
 
 
352 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  32.02 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  32.52 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  27.93 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  31.52 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
650 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  33.66 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  31.52 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  31.65 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  33.33 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  32.54 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  34.2 
 
 
607 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  29.03 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  30.43 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  30.14 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  31.4 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5945  ABC transporter related  37.24 
 
 
580 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152833  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  30.43 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  30.83 
 
 
560 aa  90.9  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0704  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  27 
 
 
320 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000206443  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  27.23 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>