More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1805 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  51.79 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  49.6 
 
 
264 aa  242  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  56.1 
 
 
265 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  45.93 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
240 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  41.33 
 
 
242 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
237 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.13 
 
 
335 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.13 
 
 
335 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 
282 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  41.4 
 
 
244 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
502 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
335 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  39.65 
 
 
507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.43 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  35.34 
 
 
342 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  39.32 
 
 
374 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  38.5 
 
 
239 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.18 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
268 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.7806299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 
335 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
510 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.71 
 
 
516 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
335 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  38.26 
 
 
243 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5613  ABC transporter related  38.53 
 
 
388 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.370742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  36.56 
 
 
242 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
335 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  34.63 
 
 
342 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1826  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 
275 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  37.72 
 
 
240 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1303  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.52 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.673171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  36.94 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  39.46 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 
369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  33.2 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.28 
 
 
364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  38.53 
 
 
369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  36.49 
 
 
245 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.15 
 
 
384 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  37.15 
 
 
385 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.78 
 
 
252 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  39.38 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  37.39 
 
 
369 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 
335 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
254 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  38.94 
 
 
247 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  38.94 
 
 
247 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  33.91 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  37.26 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08280  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  38.5 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.136601  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0489  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
341 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3565  phosphate ABC transporter permease  37.61 
 
 
259 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  36.6 
 
 
372 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 
244 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  35.68 
 
 
259 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  36.43 
 
 
376 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.66 
 
 
377 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  36.28 
 
 
249 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.24 
 
 
355 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  37.66 
 
 
369 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  35.24 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  35.24 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  35.55 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  37.99 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 
305 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1089  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 
272 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.745288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  32.82 
 
 
282 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2838  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 
265 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  35 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  35 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0854  ABC transporter related  31.89 
 
 
341 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  35 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0838  ABC transporter related  31.89 
 
 
341 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00107302  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
345 aa  135  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  36 
 
 
249 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  35 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
252 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
343 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1906  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.5 
 
 
345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0366735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  30.49 
 
 
350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2591  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318671  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0974  ABC transporter related  36.73 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0227339  unclonable  0.000000000000144331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4335  ABC transporter related  34.68 
 
 
365 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.07 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.96 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  35.86 
 
 
397 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
245 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  39.73 
 
 
266 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  35.56 
 
 
247 aa  135  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
249 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>