More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1808 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  47.72 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.99 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  32.49 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.49 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.49 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  32.49 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.49 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.49 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.67 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.27 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.01 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.83 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.49 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.83 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.83 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.83 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.83 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  32.95 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.82 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  30.51 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  33.52 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  37.36 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  37.36 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  37.93 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  37.93 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  35.96 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.31 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  36.78 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  36.78 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  36.78 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  34.27 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  37.36 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  36.21 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  38.73 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  35.2 
 
 		 617 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  33.84 
 
 		 367 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.84 
 
 		 367 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.84 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.77 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.85 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  30.81 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  31.31 
 
 		 364 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 		 365 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  36.93 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  36.36 
 
 		 365 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  37.36 
 
 		 578 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  33 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  35.63 
 
 		 266 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  34.64 
 
 		 579 aa  98.6  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  35.43 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  34.65 
 
 		 581 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  33.15 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38.51 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  30.3 
 
 		 364 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5373  ABC transporter related  33.18 
 
 		 347 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.98 
 
 		 368 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5487  ABC transporter related  33.18 
 
 		 347 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  36.61 
 
 		 570 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  35.59 
 
 		 265 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.6 
 
 		 586 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 586 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.85 
 
 		 379 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 586 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  36.76 
 
 		 578 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 		 586 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  36.76 
 
 		 578 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  30.77 
 
 		 582 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.98 
 
 		 364 aa  95.9  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  36.78 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  36.31 
 
 		 598 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4038  ABC transporter-like  33.7 
 
 		 384 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.608472 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  32.77 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  32.78 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.7 
 
 		 1018 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  32.77 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  35.23 
 
 		 341 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  31.49 
 
 		 370 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1398  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.1 
 
 		 582 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 371 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.6 
 
 		 586 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.49 
 
 		 586 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 361 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.5 
 
 		 598 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.02 
 
 		 570 aa  94.7  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  35.24 
 
 		 596 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.85 
 
 		 375 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3014  ABC transporter component  33.87 
 
 		 364 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  31.75 
 
 		 568 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  34.25 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>