More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1074 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1074  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  55.56 
 
 		 255 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  56.1 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  53.56 
 
 		 264 aa  262  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  48.59 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  40.85 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  36.84 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  37.55 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  34.06 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  34.06 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 237 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  35.68 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  35.68 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  35.24 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  36.96 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.5 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.61 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.06 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1172  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193419  normal  0.054455 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  34.06 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 		 365 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  35.78 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0645  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0719  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.153614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1053  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.588648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  35.02 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  34.16 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  35.51 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.76 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  34.07 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  33.05 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  35.32 
 
 		 243 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  36.21 
 
 		 243 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  34.8 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  35.09 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  35.53 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  34.36 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  36.95 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  35.06 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  35.53 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  33.48 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  35.22 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.68 
 
 		 225 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  34.33 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  36.29 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1172  ABC transporter related  40 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.867834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  35.09 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  34.36 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  35.5 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.62 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  35.47 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 		 516 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  33.92 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 		 510 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  37.34 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  36.96 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  33.92 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.63 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  36.12 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.68 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  36.52 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  40.28 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  34.2 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  35.68 
 
 		 336 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  34 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  33.91 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.19 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3706  ABC transporter related  36.82 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 218 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4553  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  30.08 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.82 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  34.47 
 
 		 339 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  32.91 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 		 344 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  35.53 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.18 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  36.64 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  36.18 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  36.36 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  33.33 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>