More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3072 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1144  ABC transporter, ATPase subunit  31.96 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0062  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  34.85 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.5 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.5 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 276 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.5 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0213  ABC transporter related  31.63 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  35.71 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  33.71 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  33.71 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  33.71 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  35.71 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  39.49 
 
 		 277 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  33.85 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.9 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  38.51 
 
 		 242 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  32.54 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  32.54 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  32.57 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.54 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.54 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.54 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.54 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.54 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  31.12 
 
 		 351 aa  98.6  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.08 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  32.33 
 
 		 277 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  33.14 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  38.12 
 
 		 580 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  33.17 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1057  ATPase  35.03 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  35.09 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  32.79 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  31.47 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  29.06 
 
 		 575 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  32.57 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0739  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  35 
 
 		 586 aa  92  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0348008 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  36.61 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  32.5 
 
 		 1343 aa  92  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  36.36 
 
 		 562 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.65 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  32.58 
 
 		 396 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  33.02 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  33.54 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.44 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.31 
 
 		 600 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.36 
 
 		 618 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.36 
 
 		 618 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.36 
 
 		 622 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.16 
 
 		 601 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.18 
 
 		 259 aa  89.4  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  36.87 
 
 		 552 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  35.2 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  34.36 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  32.49 
 
 		 595 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  28.43 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.64 
 
 		 590 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  37.63 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 		 265 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  31.22 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  33.17 
 
 		 298 aa  88.6  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  31.98 
 
 		 595 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0931  ABC transporter related  32.56 
 
 		 574 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  32.16 
 
 		 382 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  33.85 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  33.85 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2418  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.52 
 
 		 579 aa  88.2  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0870797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  33.85 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  32.66 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2706  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 529 aa  88.2  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  29.47 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.33 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>