More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0062 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0062  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1144  ABC transporter, ATPase subunit  50.5 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176868  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0213  ABC transporter related  41.51 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  34.83 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  33.51 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  31.31 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.31 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.31 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  31.31 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  31.31 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.31 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.31 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  32.23 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.81 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.81 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.67 
 
 		 587 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0086  ABC transporter related  33.5 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000503646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  31.28 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  31.28 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  31.78 
 
 		 364 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  35.53 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.79 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  30.23 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  31.28 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  33.84 
 
 		 365 aa  95.1  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  31.94 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  31.84 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  31.84 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  31.16 
 
 		 552 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0704  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  32.34 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000206443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3474  ABC transporter related  30.95 
 
 		 525 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  32.67 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  30.81 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  29.63 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 526 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.31 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  33.17 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  29.47 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.76 
 
 		 650 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 381 aa  93.2  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  31.98 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  30 
 
 		 253 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0210  polar amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.37 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  28.64 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  32.2 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0904  ABC transporter related  29.72 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  29.33 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  31.55 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  33 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.88 
 
 		 566 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  32.98 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3673  ABC transporter related  30 
 
 		 519 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.43 
 
 		 583 aa  92  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  30.77 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  29.52 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  35.75 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  31.73 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  34.48 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  36.6 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 		 572 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  32.5 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  33.33 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  37.13 
 
 		 534 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  31.63 
 
 		 358 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  30.29 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 		 564 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  29.44 
 
 		 359 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  30.41 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  29.74 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  33.7 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  31.28 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.99 
 
 		 564 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  33.04 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  30.73 
 
 		 590 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 		 376 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  28.5 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  36.08 
 
 		 584 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.08 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  30.89 
 
 		 350 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3834  ABC transporter related  32.83 
 
 		 359 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3347  ABC transporter related  30 
 
 		 520 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.318773  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  29.08 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 		 564 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5577  ABC transporter-related protein  30.18 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.65 
 
 		 357 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  31.65 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  31.71 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1682  ABC transporter-like protein protein  30.68 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>