More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2457 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  50.2 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  45.81 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  41.55 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1310  ABC transporter related  46.46 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1057  ATPase  45.05 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  39.89 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.18 
 
 		 632 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  33.88 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.91 
 
 		 600 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.36 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  34.36 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.74 
 
 		 580 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.05 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  40.84 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.37 
 
 		 628 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  35.27 
 
 		 1266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.11 
 
 		 639 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1654  ABC transporter related  34.08 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.89 
 
 		 641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  33.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 		 619 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  35.35 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.22 
 
 		 626 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.11 
 
 		 629 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  40.22 
 
 		 634 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  35.35 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  29.86 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  29.86 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 		 608 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.09 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  31.28 
 
 		 575 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3041  ABC transporter related  35.29 
 
 		 950 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  35.04 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3189  cell division ATP-binding protein FtsE  30.13 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  36.63 
 
 		 1343 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.31 
 
 		 616 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  33.78 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  33.18 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.01 
 
 		 627 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.48 
 
 		 605 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 		 219 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  35.43 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.87 
 
 		 603 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  34.21 
 
 		 595 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3004  cell division ATP-binding protein FtsE  30.57 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000252068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  36.27 
 
 		 595 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  40.38 
 
 		 569 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2723  hypothetical protein  34.08 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2596  hypothetical protein  34.08 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  30.63 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.5 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1126  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 		 603 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  35.37 
 
 		 595 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.6 
 
 		 1323 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  36.29 
 
 		 724 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  30.63 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.94 
 
 		 608 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  30.63 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.92 
 
 		 619 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.29 
 
 		 724 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.6 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  36.76 
 
 		 1717 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0347  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.86 
 
 		 664 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0091  ABC transporter related  36.63 
 
 		 981 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.63 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  30 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  35.12 
 
 		 980 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  34.56 
 
 		 1360 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.62 
 
 		 573 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  30.18 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0853  ABC methionine transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 		 386 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00389788  hitchhiker  0.00726443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  36 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  30.18 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.04 
 
 		 578 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  33.71 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.63 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  34.82 
 
 		 715 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>