More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4399 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  62.62 
 
 
231 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  62.15 
 
 
231 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0674  ABC transporter related  51.05 
 
 
249 aa  242  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425718  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1262  ABC transporter-like  54.5 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2790  ABC transporter-like protein protein  53.15 
 
 
260 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0852  ABC transporter related  50.21 
 
 
252 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327351  hitchhiker  0.00847775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  36.04 
 
 
339 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
339 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
346 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
339 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
339 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  35.87 
 
 
264 aa  131  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  36.05 
 
 
255 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  33.82 
 
 
341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  34.4 
 
 
593 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
346 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
341 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
397 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 
341 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
350 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0160  ABC transporter related  33.93 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  34.23 
 
 
340 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  35.91 
 
 
256 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
342 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  32.85 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  35.75 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  32.23 
 
 
253 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  36.14 
 
 
401 aa  125  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
348 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1130  ABC transporter related  34.13 
 
 
332 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
218 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  32.43 
 
 
342 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.06 
 
 
566 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.44 
 
 
345 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  35.29 
 
 
575 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0625  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
325 aa  124  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  35.87 
 
 
349 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
343 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  33.78 
 
 
267 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
343 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  34.45 
 
 
397 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  31.9 
 
 
601 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  37.26 
 
 
249 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 
335 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 
247 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2403  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 
425 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  34.1 
 
 
267 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  34.38 
 
 
244 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3992  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
360 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.777078  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
242 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 
335 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.81 
 
 
348 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.81 
 
 
348 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  34.78 
 
 
256 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  36.23 
 
 
260 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
260 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  34.38 
 
 
240 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.1 
 
 
625 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.1 
 
 
250 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 
249 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  32.61 
 
 
349 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  33.64 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  34.78 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0595  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.062853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  36.23 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2681  ABC transporter related  33.64 
 
 
372 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  31.87 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  34.78 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  34.78 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.78 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  33.78 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  31.84 
 
 
593 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  31.51 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 
344 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  30.7 
 
 
273 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>