More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1310 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1310  ABC transporter related  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  57.99 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  52.51 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1057  ATPase  57.27 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  46.46 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  48.35 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  40.68 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  39.11 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  38.89 
 
 		 432 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.38 
 
 		 1323 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 381 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  33.97 
 
 		 723 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  35.19 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  34.63 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  35.75 
 
 		 724 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  35.75 
 
 		 724 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  36.07 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  35.48 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 395 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2131  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 238 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  34.88 
 
 		 715 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  31.98 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  34.1 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  34.65 
 
 		 726 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1140  ABC transporter related  40.12 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  34.1 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.8 
 
 		 600 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  34.6 
 
 		 726 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  34.05 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  35.19 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  34.13 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  35.44 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.53 
 
 		 582 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  34.85 
 
 		 725 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  37.57 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1234  cell division ATP-binding protein FtsE  31.9 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  34.23 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  31.88 
 
 		 738 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  35.71 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  30.96 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  34.65 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  30.96 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  33.66 
 
 		 725 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  34.3 
 
 		 727 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  34.87 
 
 		 725 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  32 
 
 		 712 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  30.96 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.12 
 
 		 625 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  31.75 
 
 		 776 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.96 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  37.77 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  33 
 
 		 712 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  35.02 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  33.5 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  34.54 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  32.49 
 
 		 651 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0989  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  36.55 
 
 		 573 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  33.5 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  34.87 
 
 		 725 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0277  peptide ABC transporter ATPase  35.41 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  36.46 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  31.82 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  34.07 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  32.31 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  34.3 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  34.69 
 
 		 583 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  36 
 
 		 719 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  33.18 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  34.1 
 
 		 650 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  34.95 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  38.92 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  34.32 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>