More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1836 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  49.15 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  49.72 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  48.94 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  47.78 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  48.85 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  48.98 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  51.15 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  49.21 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  47.4 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  49.5 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  50.3 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  45.73 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  49.08 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  38.12 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.5 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  34 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.47 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  35.71 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  30.46 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  30.46 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.17 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  36.68 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  30.85 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 276 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.43 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  30.85 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.43 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.43 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.43 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.43 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  28.14 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  32.99 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2054  ABC transporter related  36.02 
 
 		 619 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3849  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  34.15 
 
 		 609 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  32.49 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0081  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  33.01 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  34.54 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  34.8 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  38 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  36.36 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  30.88 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 369 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  33.17 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  33.01 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  39 
 
 		 368 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  35.32 
 
 		 255 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  35.18 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.16 
 
 		 268 aa  99  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  33.5 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  32.83 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  29.82 
 
 		 252 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4448  ABC transporter related  33.82 
 
 		 287 aa  98.6  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3454  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.23 
 
 		 603 aa  98.6  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0184148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 369 aa  98.2  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  35.44 
 
 		 598 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.81 
 
 		 502 aa  98.2  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  36.1 
 
 		 266 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0674  ABC transporter related  32.64 
 
 		 249 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425718  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  37.56 
 
 		 260 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 192 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  32.38 
 
 		 507 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  33.67 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.69 
 
 		 357 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  32.86 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  33.84 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  31.4 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  31.88 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  37.31 
 
 		 375 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3127  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.84 
 
 		 651 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0840  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.5 
 
 		 645 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  31.35 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  35.5 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 308 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  29.85 
 
 		 332 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  35.86 
 
 		 260 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 		 333 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>