More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5031 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  56.01 
 
 		 596 aa  704    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  69.5 
 
 		 602 aa  887    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  51.27 
 
 		 598 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  51 
 
 		 597 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  51.67 
 
 		 598 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  53.49 
 
 		 596 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 603 aa  1250    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  53.89 
 
 		 596 aa  674    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  50 
 
 		 615 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  49.32 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  46.77 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 619 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 		 631 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  39.83 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.14 
 
 		 616 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  38.79 
 
 		 628 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  39.28 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.41 
 
 		 607 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.15 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.75 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.06 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.97 
 
 		 610 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.17 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 		 594 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 		 613 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 620 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 593 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 593 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 620 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 590 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 594 aa  360  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  34.73 
 
 		 624 aa  359  9e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 520 aa  357  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  34.05 
 
 		 607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.46 
 
 		 613 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 599 aa  352  8e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  35.37 
 
 		 653 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 		 607 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  38.17 
 
 		 517 aa  349  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  34.02 
 
 		 628 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  35.93 
 
 		 594 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  38.39 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  35.92 
 
 		 591 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 519 aa  343  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  38.77 
 
 		 527 aa  343  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 595 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.15 
 
 		 622 aa  342  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 		 666 aa  342  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  35.51 
 
 		 593 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  34.38 
 
 		 659 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.38 
 
 		 685 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 526 aa  339  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 641 aa  339  8e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  33.65 
 
 		 656 aa  339  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  31.96 
 
 		 671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  34.75 
 
 		 610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  39.15 
 
 		 521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  32.35 
 
 		 649 aa  336  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 601 aa  336  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  33.81 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  37.8 
 
 		 520 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  33.13 
 
 		 692 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  34.98 
 
 		 682 aa  335  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.12 
 
 		 613 aa  334  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 527 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 603 aa  332  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  33.5 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 643 aa  331  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 		 638 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 		 625 aa  332  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.53 
 
 		 614 aa  331  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 527 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  32.54 
 
 		 684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 		 617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  34.13 
 
 		 705 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  33.49 
 
 		 675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  32.96 
 
 		 619 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 		 617 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  31.43 
 
 		 608 aa  328  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  31.43 
 
 		 623 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 650 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  31.6 
 
 		 611 aa  327  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  32.57 
 
 		 599 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  34.49 
 
 		 644 aa  326  9e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>