More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0946 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  77.81 
 
 		 1101 aa  1772    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1229 aa  2549    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  81.37 
 
 		 1226 aa  2050    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 748 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 		 521 aa  187  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 473 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 748 aa  175  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 489 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 801 aa  164  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 493 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 357 aa  162  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.17 
 
 		 2361 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 357 aa  160  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 357 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 526 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 986 aa  160  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 420 aa  158  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 658 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 490 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  31.33 
 
 		 525 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 662 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 378 aa  154  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.23 
 
 		 662 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 359 aa  154  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 800 aa  154  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.66 
 
 		 515 aa  153  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 700 aa  153  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  30.43 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  30.43 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 450 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 448 aa  152  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 700 aa  152  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 695 aa  151  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.36 
 
 		 772 aa  151  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 363 aa  151  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.71 
 
 		 640 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  30.92 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 366 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 370 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 599 aa  149  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  30 
 
 		 799 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 378 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 1177 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 485 aa  147  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 492 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  31.39 
 
 		 671 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 463 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 492 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 573 aa  147  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 492 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.23 
 
 		 492 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 492 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 463 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 1019 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 799 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.16 
 
 		 687 aa  145  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 775 aa  145  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  38.68 
 
 		 680 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  38.68 
 
 		 680 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 		 619 aa  145  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  34.96 
 
 		 344 aa  145  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  34.96 
 
 		 344 aa  145  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 703 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  29.01 
 
 		 830 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.07 
 
 		 683 aa  144  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 700 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.61 
 
 		 1278 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 700 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 700 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 770 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.4 
 
 		 379 aa  142  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  31.34 
 
 		 463 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 2072 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 684 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  39.22 
 
 		 381 aa  141  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 490 aa  142  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  39.22 
 
 		 381 aa  141  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 707 aa  142  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 703 aa  141  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  36.77 
 
 		 459 aa  141  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 485 aa  141  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 381 aa  141  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 780 aa  141  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 749 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 484 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 3706 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 671 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  32.76 
 
 		 965 aa  140  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  31.39 
 
 		 670 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 795 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 795 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  38.32 
 
 		 497 aa  139  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 780 aa  138  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 384 aa  138  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 384 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 462 aa  137  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 462 aa  137  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 535 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  35.11 
 
 		 344 aa  136  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>