More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1845 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 404 aa  794    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  66.25 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  65.99 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 407 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  36.02 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  31.55 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  31.04 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  30.03 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  34.69 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  32.91 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.79 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.01 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 430 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 430 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  28.01 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.97 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.08 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  30 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  33.12 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.32 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  25.58 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  25.58 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  28.71 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1257  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.375741  hitchhiker  0.00856521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  28.29 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>