More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3239 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
397 aa  781    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  83.33 
 
 
400 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  78.59 
 
 
397 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  78.73 
 
 
397 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  71.28 
 
 
406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  67.34 
 
 
410 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  68.27 
 
 
403 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  68.02 
 
 
403 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  68.27 
 
 
403 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  68.02 
 
 
403 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  61.17 
 
 
411 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  61.38 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  61.38 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  61.38 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  61.38 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  61.38 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  61.64 
 
 
408 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  61.22 
 
 
409 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  61.89 
 
 
404 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  61.89 
 
 
404 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  61.64 
 
 
404 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  61.64 
 
 
404 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  61.64 
 
 
404 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  48.43 
 
 
410 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  48.98 
 
 
403 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  49.09 
 
 
404 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  46.74 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  48.43 
 
 
404 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  48.43 
 
 
404 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  48.17 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  48.17 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  48.17 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  48.17 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  48.17 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  48.17 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  48.17 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  47.64 
 
 
398 aa  339  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  45.43 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  46.05 
 
 
411 aa  334  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
399 aa  315  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
406 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  43.23 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  41.03 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  41.98 
 
 
407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
413 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 
413 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  42.39 
 
 
406 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  43.35 
 
 
431 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.51 
 
 
416 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  42.56 
 
 
487 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  46.07 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  41.04 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  38.69 
 
 
420 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
423 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  40.16 
 
 
416 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
415 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  37.31 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
407 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
410 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  35.38 
 
 
401 aa  223  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
406 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  33.84 
 
 
394 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  35.43 
 
 
412 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  34.1 
 
 
394 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
404 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  34.57 
 
 
407 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.52 
 
 
450 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  25.83 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  25.83 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.54 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.92 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.42 
 
 
411 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
425 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.33 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.61 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.81 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  24.87 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.11 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  24.85 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.22 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.36 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.41 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.38 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  26.38 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  26.38 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  26.38 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  32.31 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.41 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.08 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  24.78 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>