More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1669 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  500  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.7 
 
 
239 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  48.11 
 
 
240 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  49.05 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  43.4 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
222 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  39.35 
 
 
238 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  41.63 
 
 
228 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 
238 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  49.74 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  39.55 
 
 
270 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  35.48 
 
 
235 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  39.53 
 
 
235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  39.13 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  38.53 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  38.97 
 
 
228 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  37.5 
 
 
247 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  35.94 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2979  ABC transporter related  41.86 
 
 
226 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  34.91 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  37.14 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  33.63 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  39.45 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4056  hypothetical protein  41.84 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0200759  normal  0.24116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  38.5 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.3 
 
 
646 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  36.92 
 
 
240 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  37.66 
 
 
241 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
253 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 
233 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  37.23 
 
 
236 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  39.25 
 
 
223 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
227 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  35.96 
 
 
248 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  34.48 
 
 
253 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  34.19 
 
 
230 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
253 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  34.15 
 
 
253 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
255 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  40.19 
 
 
236 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
270 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  36.13 
 
 
234 aa  122  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
235 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 
221 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  39.15 
 
 
228 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  35.8 
 
 
245 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  35.48 
 
 
644 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
255 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
255 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  36.14 
 
 
232 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  38.91 
 
 
224 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  36.51 
 
 
256 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  35.05 
 
 
244 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  38.79 
 
 
234 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  39.25 
 
 
236 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  32.51 
 
 
668 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.57 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  37.86 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  34.29 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  34.22 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  42.39 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  33.99 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  39.72 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  38.21 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  36.23 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  40 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  35.29 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  37.74 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  33.17 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  39.51 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  39.57 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  36.36 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.49 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  36.67 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  38.07 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  32.09 
 
 
226 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  39.25 
 
 
236 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  39.25 
 
 
236 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  30.64 
 
 
286 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
255 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  36.67 
 
 
223 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 
255 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.41 
 
 
357 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>