More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0259 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1167    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  44.24 
 
 		 572 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  39.93 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  40.67 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  40.49 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 560 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  40.33 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  40.15 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  40.15 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  40.15 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.96 
 
 		 560 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  40.15 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  40.15 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  40.33 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  41.28 
 
 		 554 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  41.04 
 
 		 467 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  39.5 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  36.55 
 
 		 584 aa  323  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  36.28 
 
 		 584 aa  319  9e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.8 
 
 		 805 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 921 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 941 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 933 aa  219  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 941 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.89 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.87 
 
 		 966 aa  217  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.88 
 
 		 801 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.41 
 
 		 1116 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.19 
 
 		 835 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  32.96 
 
 		 915 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1144 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  32.96 
 
 		 916 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  32.96 
 
 		 915 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.8 
 
 		 969 aa  213  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.36 
 
 		 1138 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 		 877 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.74 
 
 		 961 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.81 
 
 		 962 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.26 
 
 		 951 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.98 
 
 		 894 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1137 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  31.26 
 
 		 541 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.1 
 
 		 1147 aa  187  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 963 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  28.82 
 
 		 1043 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  28.94 
 
 		 966 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 937 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  29.04 
 
 		 1037 aa  180  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.61 
 
 		 919 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 		 947 aa  178  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 		 967 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.08 
 
 		 900 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  27.47 
 
 		 932 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.38 
 
 		 971 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 963 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.34 
 
 		 1046 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  27.7 
 
 		 949 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.94 
 
 		 960 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  29.82 
 
 		 970 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  27.92 
 
 		 968 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.67 
 
 		 969 aa  166  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 942 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.13 
 
 		 1013 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 964 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  28.92 
 
 		 968 aa  164  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.99 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  29.12 
 
 		 942 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 968 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  28.16 
 
 		 919 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  29.98 
 
 		 973 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  29.03 
 
 		 968 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  27.83 
 
 		 937 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  27.66 
 
 		 968 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  29.4 
 
 		 968 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  29.43 
 
 		 968 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  28.7 
 
 		 969 aa  159  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  29.29 
 
 		 943 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  27.43 
 
 		 969 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.89 
 
 		 898 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  29.3 
 
 		 968 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  29.34 
 
 		 947 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  29.42 
 
 		 969 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  29.26 
 
 		 968 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  29.26 
 
 		 968 aa  157  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  29.25 
 
 		 968 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  29.25 
 
 		 968 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  29.59 
 
 		 966 aa  156  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  29.06 
 
 		 968 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 1046 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  29.06 
 
 		 968 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  28.06 
 
 		 967 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  29.25 
 
 		 968 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  28.73 
 
 		 968 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  29.18 
 
 		 968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  29.18 
 
 		 968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>