78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4560 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 194 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  70.31 
 
 		 196 aa  299  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.22 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.08 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  37.5 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.37 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  39.15 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  35.23 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  35.05 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  38.17 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  35.08 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.04 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.02 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  36.46 
 
 		 255 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  35.2 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  32.65 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.36 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  35.75 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  37.16 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 		 544 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  31.79 
 
 		 214 aa  130  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.2 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  37.17 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  36.08 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  37.17 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  35.71 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.08 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  33.16 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  33.68 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.94 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.16 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.68 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 		 545 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  33.87 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.07 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  30.5 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  33.16 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.52 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  31.82 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  31.94 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.12 
 
 		 559 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  30.81 
 
 		 570 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  31.31 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.68 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000854832  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 553 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  31.25 
 
 		 234 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.27 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  31.1 
 
 		 594 aa  94.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  30.63 
 
 		 598 aa  89  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.74 
 
 		 550 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  29.21 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.43 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.67 
 
 		 580 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  26.53 
 
 		 333 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  27.18 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.67 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.6 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  28.23 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0136  hypothetical protein  26.67 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.73 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.83 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  26.89 
 
 		 170 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  24.37 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  23.12 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.67 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.12 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  27.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0553  hypothetical protein  25.6 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  25.83 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  29.75 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1015  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.3 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  24.42 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.46 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  25 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0383  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 227 aa  42  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.14 
 
 		 177 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>