16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0553 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0553  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  40.46 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  28.88 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0564  hypothetical protein  30.23 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.567175  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  23.95 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0383  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0590  hypothetical protein  34.02 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108744  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1546  hypothetical protein  33.96 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0136  hypothetical protein  19.41 
 
 
231 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1709  hypothetical protein  28.12 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222121  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  25.6 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.28 
 
 
558 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0044  hypothetical protein  28.12 
 
 
231 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  25.83 
 
 
170 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0889  hypothetical protein  24.59 
 
 
216 aa  45.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.231937  normal  0.86542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>