111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3648 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 
622 aa  1243    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  45.93 
 
 
658 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  44.6 
 
 
581 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  41.81 
 
 
604 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  42.5 
 
 
531 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  44.22 
 
 
643 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  40.29 
 
 
550 aa  349  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  40.78 
 
 
624 aa  347  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  41.68 
 
 
539 aa  346  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  41.87 
 
 
563 aa  346  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  40.53 
 
 
639 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  39.52 
 
 
542 aa  343  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  42.44 
 
 
529 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  42.12 
 
 
491 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  42.06 
 
 
572 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  40.64 
 
 
571 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  42.44 
 
 
533 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  39.13 
 
 
574 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  39.33 
 
 
551 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  40.15 
 
 
561 aa  300  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  37.73 
 
 
530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  36.3 
 
 
550 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  37.96 
 
 
543 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  34.77 
 
 
508 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.55 
 
 
641 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  34.1 
 
 
600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  36.03 
 
 
531 aa  259  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  49.72 
 
 
629 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  35.33 
 
 
606 aa  256  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  35.07 
 
 
581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  35.07 
 
 
581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  36.09 
 
 
589 aa  254  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  34.07 
 
 
591 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  34.8 
 
 
593 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  35.24 
 
 
666 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  35.24 
 
 
666 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  34.77 
 
 
586 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  33.06 
 
 
586 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.66 
 
 
548 aa  247  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  56.14 
 
 
578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  35.91 
 
 
518 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  35.36 
 
 
645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  35.29 
 
 
632 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  34 
 
 
561 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  33.56 
 
 
510 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  32.53 
 
 
518 aa  194  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  46.42 
 
 
524 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  46.01 
 
 
514 aa  190  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  48.85 
 
 
475 aa  190  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  46.01 
 
 
528 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  45.26 
 
 
513 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  48.68 
 
 
555 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  30.41 
 
 
544 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  44.22 
 
 
543 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  53.07 
 
 
531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  42.08 
 
 
568 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  61.67 
 
 
188 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  40.41 
 
 
527 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.02 
 
 
450 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  37.07 
 
 
515 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.07 
 
 
515 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  46.24 
 
 
261 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  54.55 
 
 
262 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  54.55 
 
 
262 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  30.29 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  31.08 
 
 
449 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.5 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  31.74 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  33.56 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  39.5 
 
 
946 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 
932 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  37.5 
 
 
919 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  22.64 
 
 
432 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  31.17 
 
 
432 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  32.41 
 
 
415 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  34.82 
 
 
673 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  48.89 
 
 
1036 aa  57.4  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  35.23 
 
 
255 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  41.67 
 
 
468 aa  53.9  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 
343 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  34.57 
 
 
784 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  36.17 
 
 
408 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  23.97 
 
 
403 aa  52.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.7 
 
 
361 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  23.79 
 
 
441 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  23.97 
 
 
403 aa  52.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  31.06 
 
 
186 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  35.71 
 
 
500 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  30.52 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  33.33 
 
 
424 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.21 
 
 
330 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  39.29 
 
 
400 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40.68 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.71 
 
 
414 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.07 
 
 
1821 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  40.3 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  40.68 
 
 
414 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  29.6 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  26.47 
 
 
1710 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>