More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0656 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 312 aa  609  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  49.67 
 
 		 311 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 312 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  42.17 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.29 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  40.64 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  38.58 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  40.59 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  38.18 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.1 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  37.66 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.11 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.73 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.26 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1472  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.86 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>