More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0414 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  58.82 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  58.31 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.06 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  56.46 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.78 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  57.7 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 356 aa  421  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  56.53 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.36 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 357 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  57.89 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  57.26 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  55.81 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  56.89 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 359 aa  401  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  54.37 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  56.6 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.09 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  53.24 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0615  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  54.08 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.89 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  52.68 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>