More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2529 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
243 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.12 
 
 
248 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  44.44 
 
 
706 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  46.24 
 
 
462 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  40.17 
 
 
706 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  43.69 
 
 
334 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  42.86 
 
 
539 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  42.29 
 
 
306 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.41 
 
 
308 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 
306 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  42.05 
 
 
581 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.5 
 
 
582 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
361 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.92 
 
 
542 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.01 
 
 
406 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.01 
 
 
406 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
280 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 
308 aa  141  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.47 
 
 
471 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
547 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.86 
 
 
357 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
428 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
371 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  40.41 
 
 
442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.5 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  39.2 
 
 
233 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.64 
 
 
1022 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
446 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
404 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.81 
 
 
373 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
1421 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
605 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  41.62 
 
 
617 aa  125  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  41.94 
 
 
750 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.43 
 
 
988 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
649 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.57 
 
 
1056 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.05 
 
 
261 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  42.36 
 
 
178 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
1276 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.05 
 
 
738 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37 
 
 
818 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
306 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
927 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
515 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.1 
 
 
286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.31 
 
 
1240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.5 
 
 
784 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.22 
 
 
1056 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
392 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
422 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.02 
 
 
286 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
292 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.78 
 
 
746 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  35.45 
 
 
369 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
271 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.73 
 
 
820 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 
202 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
279 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 
425 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
290 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
804 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
292 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
356 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 
458 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
687 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
376 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 
778 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  45.87 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
750 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  30.57 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  37.25 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
543 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
543 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.91 
 
 
385 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
295 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
699 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
628 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  30.05 
 
 
295 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
187 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
246 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
458 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
732 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.88 
 
 
745 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>