More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2098 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  56.64 
 
 		 289 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  54.41 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.64 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  40.16 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  44.91 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  39.13 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  39.13 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  39.74 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  37.85 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  37.85 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  41.59 
 
 		 254 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  37.45 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  37.45 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  37.45 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  37.45 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  37.45 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  37.7 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  37.7 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  37.45 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  37.45 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  42.52 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  42.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  38.4 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  41.55 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  41.55 
 
 		 253 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  37.9 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  37.44 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  36.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  40.74 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  42.25 
 
 		 604 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  42.25 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  42.25 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  41.31 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  40.47 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 		 261 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  33.94 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.88 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.61 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.15 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  26.64 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  29.07 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.87 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.14 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  26.88 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  26.97 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  26.7 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  24.89 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  29.34 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  25.86 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  26.82 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  28.75 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 489 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  25.51 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  23.83 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  24.88 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.88 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  24.77 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  24.6 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  26.14 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  24.6 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  26.56 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  24.7 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  25.2 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  24.6 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>