More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1058 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 467 aa  930    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  53.56 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  54 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  52.68 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  53.78 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  52.25 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  52.46 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  52.25 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  53.09 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  51.29 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  53.78 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  53.78 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  52.35 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  51.19 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  52.27 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  52.27 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  51.84 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  52.05 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  47.52 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  52.71 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  47.52 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  54.52 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  44.95 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  46.84 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  46.84 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  46.01 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  47.05 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  46.23 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  45.49 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  45.38 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  45.38 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  44.67 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  44.73 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  45.26 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  44.03 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  44.56 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  44.94 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  44.44 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  43.51 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  42.39 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  42.39 
 
 		 446 aa  332  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  42.76 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  42.74 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.31 
 
 		 432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.82 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.56 
 
 		 495 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  34.77 
 
 		 517 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  35.92 
 
 		 497 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  33.98 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  48.41 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  33.52 
 
 		 517 aa  273  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  36.61 
 
 		 477 aa  272  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  36.46 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.08 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.08 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.45 
 
 		 527 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 		 510 aa  269  7e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  34.59 
 
 		 497 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.93 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  34.92 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  34.35 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  37.8 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.98 
 
 		 516 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  34.47 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  35.78 
 
 		 483 aa  259  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  34.47 
 
 		 499 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  33.98 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  34.38 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  32.55 
 
 		 495 aa  249  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  33.07 
 
 		 516 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  36.25 
 
 		 544 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  33.04 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.25 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  30.77 
 
 		 490 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.76 
 
 		 499 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.3 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  31.86 
 
 		 511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 		 484 aa  223  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  31.54 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  31.94 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  31.3 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  30.19 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  31.5 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  32.3 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  34.71 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  31.8 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.21 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.07 
 
 		 516 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  41.55 
 
 		 533 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  29.26 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  29.7 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.25 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>