More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1011 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  100 
 
 
1019 aa  2125    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  38.02 
 
 
1024 aa  661    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  43.46 
 
 
1129 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  40.1 
 
 
1084 aa  731    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 
1049 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  36.87 
 
 
1029 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  39.4 
 
 
1455 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  38.24 
 
 
1035 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  36.58 
 
 
1046 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  35.99 
 
 
1043 aa  658    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  38.48 
 
 
1044 aa  675    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  39.94 
 
 
1084 aa  745    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  36.71 
 
 
1032 aa  656    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  37.51 
 
 
1094 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  37.57 
 
 
1024 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  37.57 
 
 
1024 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  37.67 
 
 
1024 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.67 
 
 
1024 aa  635  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  37.67 
 
 
1024 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  36.5 
 
 
1045 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  37.67 
 
 
1024 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  37.76 
 
 
1024 aa  632  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.71 
 
 
1033 aa  631  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  36.91 
 
 
1041 aa  632  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.5 
 
 
1063 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  37.82 
 
 
1043 aa  626  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 
1045 aa  629  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  36.4 
 
 
1028 aa  625  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  36.44 
 
 
1043 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  36.19 
 
 
1036 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  34.89 
 
 
1066 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  35.27 
 
 
1050 aa  612  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  34.8 
 
 
1066 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 
1079 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.59 
 
 
1026 aa  601  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.5 
 
 
1013 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.02 
 
 
1036 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  34.21 
 
 
1164 aa  595  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  35.23 
 
 
1036 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  34.68 
 
 
1035 aa  588  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  34.35 
 
 
1112 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  33.36 
 
 
1108 aa  578  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.46 
 
 
1053 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  35.16 
 
 
1031 aa  570  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  33.18 
 
 
1076 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
1077 aa  568  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  33.88 
 
 
1020 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  33.76 
 
 
1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  34.73 
 
 
1024 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.88 
 
 
1041 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.04 
 
 
1289 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  33.43 
 
 
1059 aa  556  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.84 
 
 
1033 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.56 
 
 
1264 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.51 
 
 
1030 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  33.1 
 
 
1012 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.19 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.19 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.3 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.3 
 
 
1030 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  33.19 
 
 
1030 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.19 
 
 
1030 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  33.19 
 
 
1030 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.79 
 
 
1030 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.28 
 
 
1005 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  31.3 
 
 
1030 aa  515  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  31.27 
 
 
1032 aa  515  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.71 
 
 
1030 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  32.68 
 
 
1017 aa  506  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  32.53 
 
 
1003 aa  506  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  32.31 
 
 
1008 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  33.71 
 
 
1023 aa  502  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  32.44 
 
 
1026 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  31.62 
 
 
1023 aa  486  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.47 
 
 
968 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.49 
 
 
992 aa  465  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.89 
 
 
1329 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.89 
 
 
1018 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.12 
 
 
1009 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  30.64 
 
 
1021 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.02 
 
 
1012 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.36 
 
 
992 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 
1017 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.21 
 
 
1003 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.61 
 
 
1004 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
1020 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.12 
 
 
1424 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
1022 aa  361  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
640 aa  355  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.25 
 
 
996 aa  332  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 
628 aa  315  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.65 
 
 
1600 aa  297  6e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.64 
 
 
920 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
987 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  38.06 
 
 
349 aa  238  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 
951 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.11 
 
 
920 aa  205  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.44 
 
 
972 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.6 
 
 
858 aa  175  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  29.7 
 
 
743 aa  169  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>