More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1364 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1364  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
385 aa  781    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00282102  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  51.7 
 
 
410 aa  420  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1485  cystathionine gamma-synthase  52.49 
 
 
383 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.923651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  50.26 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0243  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.814419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 
408 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 
392 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 
392 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  40.84 
 
 
391 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  40.84 
 
 
391 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 
392 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40.42 
 
 
380 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.83 
 
 
386 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 
391 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  41.51 
 
 
392 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  40.99 
 
 
392 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  40.99 
 
 
392 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  40.49 
 
 
386 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  39.47 
 
 
378 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  40.99 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.89 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.89 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.89 
 
 
387 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  42.16 
 
 
374 aa  272  7e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 
392 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.57 
 
 
388 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.45 
 
 
386 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 
386 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.62 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.35 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  38.83 
 
 
392 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
400 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.31 
 
 
390 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  37.91 
 
 
393 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  40.48 
 
 
390 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  36.57 
 
 
386 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  39.08 
 
 
393 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.96 
 
 
394 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.76 
 
 
397 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 
376 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  40.57 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  38.7 
 
 
394 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  38.14 
 
 
390 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.36 
 
 
388 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.25 
 
 
393 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1237  cystathionine gamma-synthase  36.96 
 
 
398 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.1 
 
 
392 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  38.81 
 
 
393 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
394 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  40.36 
 
 
392 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.13 
 
 
387 aa  263  3e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.53 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.08 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  38.92 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  39.95 
 
 
391 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  37.6 
 
 
381 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  37.77 
 
 
405 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  38.22 
 
 
380 aa  260  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  38.38 
 
 
394 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  36.49 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  39.74 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  39.37 
 
 
386 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  37.98 
 
 
392 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  37.66 
 
 
383 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.7 
 
 
386 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  36.76 
 
 
386 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  39.06 
 
 
390 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
397 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4007  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
370 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  38.01 
 
 
367 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.89 
 
 
381 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4389  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
370 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  36.12 
 
 
386 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  38.79 
 
 
401 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4370  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 
370 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 
378 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  35.9 
 
 
425 aa  255  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4110  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 
370 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  36.53 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  35.68 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4336  cystathionine gamma-synthase  39.57 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  37.47 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  34.69 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  36.76 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  39.02 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  37.92 
 
 
390 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  37.43 
 
 
381 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  36.76 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  36.72 
 
 
394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  35.68 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  38.42 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4158  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4276  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4480  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  39.16 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  36.29 
 
 
388 aa  252  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  36.75 
 
 
392 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 
377 aa  252  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>