293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1328 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0429  extracellular solute-binding protein family 5  53.34 
 
 		 726 aa  639    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585941  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1328  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 734 aa  1467    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0036093  normal  0.504414 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 675 aa  264  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  21.15 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 595 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.14 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.46 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.46 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.46 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2203  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 872 aa  75.5  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000826446 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 544 aa  73.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  21.38 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  23.94 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2474  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  21.48 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.41 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  21.35 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  21.18 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  21.18 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  21.35 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.02 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  21.62 
 
 		 537 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.09 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.02 
 
 		 516 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  21.18 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.09 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  23.94 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.68 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 544 aa  63.9  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  21.36 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 556 aa  63.9  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  21.19 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  23.23 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  22.04 
 
 		 516 aa  62  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.04 
 
 		 580 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.53 
 
 		 579 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  24.3 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5634  hypothetical protein  22.88 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00869862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.54 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 556 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.81 
 
 		 586 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  23.95 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  20.49 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  21.43 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  23.82 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  21.57 
 
 		 560 aa  57.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  21.03 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  21.68 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  22.58 
 
 		 580 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 544 aa  56.6  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  20.71 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 525 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.89 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 524 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  22.75 
 
 		 528 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  21.28 
 
 		 538 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  22.04 
 
 		 535 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  36.96 
 
 		 497 aa  55.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  21.28 
 
 		 538 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 538 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  20.45 
 
 		 622 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 561 aa  55.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  30.97 
 
 		 495 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.99 
 
 		 509 aa  55.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2178  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 561 aa  55.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  21.51 
 
 		 560 aa  55.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 506 aa  55.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 547 aa  54.7  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  19.86 
 
 		 532 aa  54.3  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 506 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 564 aa  54.3  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.31 
 
 		 520 aa  54.3  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 528 aa  54.3  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 537 aa  54.3  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 533 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>