More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3193 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  37.9 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2043  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000225663  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 227 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.14 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  25.71 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 265 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 		 277 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  24.41 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4702  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  27.83 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0767  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.933117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1647  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0582  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.414159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0693  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>