More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0023 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  74.12 
 
 		 230 aa  351  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  57.21 
 
 		 226 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  52.86 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  56.16 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  55.61 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.66 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.43 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.18 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>