More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8426 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.9 
 
 		 653 aa  684    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.32 
 
 		 672 aa  873    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.04 
 
 		 696 aa  796    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.59 
 
 		 794 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 		 602 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.05 
 
 		 704 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.43 
 
 		 639 aa  652    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  66.72 
 
 		 682 aa  874    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.14 
 
 		 760 aa  747    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.95 
 
 		 662 aa  810    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  67.91 
 
 		 760 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.37 
 
 		 750 aa  648    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.47 
 
 		 657 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.39 
 
 		 669 aa  847    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.76 
 
 		 743 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.29 
 
 		 687 aa  827    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.73 
 
 		 798 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.75 
 
 		 698 aa  802    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  67.08 
 
 		 753 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.55 
 
 		 759 aa  657    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 672 aa  1358    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.53 
 
 		 753 aa  837    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.73 
 
 		 685 aa  850    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  55.18 
 
 		 697 aa  689    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.6 
 
 		 615 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.62 
 
 		 671 aa  802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.77 
 
 		 643 aa  649    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.28 
 
 		 679 aa  860    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.78 
 
 		 659 aa  872    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  57.23 
 
 		 783 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.67 
 
 		 651 aa  647    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  57.28 
 
 		 627 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.64 
 
 		 669 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.45 
 
 		 793 aa  725    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 		 611 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  57.39 
 
 		 784 aa  704    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.79 
 
 		 684 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.92 
 
 		 684 aa  859    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  63.51 
 
 		 689 aa  825    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.06 
 
 		 801 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.91 
 
 		 671 aa  823    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  67.56 
 
 		 656 aa  914    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.14 
 
 		 769 aa  644    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  67.99 
 
 		 654 aa  857    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  67.48 
 
 		 681 aa  858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  57.23 
 
 		 783 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.03 
 
 		 781 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.84 
 
 		 682 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63 
 
 		 677 aa  786    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.22 
 
 		 620 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.51 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.51 
 
 		 610 aa  631  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.98 
 
 		 635 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.98 
 
 		 632 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.46 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  60.16 
 
 		 614 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 		 639 aa  628  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.64 
 
 		 616 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  59.68 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.08 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.49 
 
 		 633 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.51 
 
 		 612 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 		 612 aa  618  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.97 
 
 		 617 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  53.02 
 
 		 633 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.69 
 
 		 652 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.4 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.17 
 
 		 633 aa  618  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  52.86 
 
 		 633 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.16 
 
 		 633 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.36 
 
 		 783 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.81 
 
 		 614 aa  614  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.24 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.24 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  62.66 
 
 		 645 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.9 
 
 		 617 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.39 
 
 		 638 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 		 604 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.5 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.12 
 
 		 635 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  50.89 
 
 		 637 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.2 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  59.68 
 
 		 652 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.5 
 
 		 630 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  60.45 
 
 		 693 aa  608  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.8 
 
 		 645 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.76 
 
 		 612 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  58.49 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.11 
 
 		 621 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.87 
 
 		 676 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  58.52 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.2 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 637 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 		 647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>