More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1316 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  100 
 
 		 427 aa  887    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  50.93 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  50.27 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 411 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  48.72 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  48.34 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  49.73 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  46.98 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  48.13 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  48.66 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  48.12 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  44.94 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  49.22 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  45.78 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  46.77 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  42.37 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  39.64 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  42.05 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.3 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  39.85 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  39.25 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  37.01 
 
 		 430 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 		 470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  40.29 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  37.99 
 
 		 413 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  37.73 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  34.82 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.15 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  36.91 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  36.56 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  35.12 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  36.87 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  35.23 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.81 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  34.72 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.96 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  34.99 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  35.69 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  38.01 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  38.01 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  35.82 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  35.51 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  35.82 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  35.79 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  39.14 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  36.98 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  38.11 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  35.5 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  35.94 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  35.47 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  35.18 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  35.87 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  35.5 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  33.68 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.87 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  32.7 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  36.03 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  35.43 
 
 		 720 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  37.61 
 
 		 470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  36.7 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.25 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  34.1 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  35.04 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  35 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  34.64 
 
 		 481 aa  236  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  34.01 
 
 		 419 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  36.58 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  34.38 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  30.75 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  35.2 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  33.93 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  33.92 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  35.16 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  35.06 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  36.09 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  34.45 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>