More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0675 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  100 
 
 		 547 aa  1134    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  51.92 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  51.1 
 
 		 547 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  43.81 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  44.59 
 
 		 554 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  43.64 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 554 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 554 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 554 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 		 551 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.26 
 
 		 563 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 546 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  41.22 
 
 		 558 aa  432  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.22 
 
 		 563 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  39.11 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  38.81 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 559 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 560 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  37.06 
 
 		 598 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 598 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 553 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  37.06 
 
 		 553 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 566 aa  346  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  34.69 
 
 		 555 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  34.13 
 
 		 555 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 596 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 607 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 		 609 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.5 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 610 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  29.73 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 633 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 590 aa  240  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  30.23 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 649 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 630 aa  238  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 592 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.98 
 
 		 610 aa  236  6e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 616 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 592 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 620 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 598 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 612 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.46 
 
 		 602 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3837  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.78 
 
 		 611 aa  228  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 594 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 607 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.5 
 
 		 597 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 597 aa  224  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  27.92 
 
 		 587 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  29.16 
 
 		 602 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 603 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 618 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 603 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  27.59 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 626 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.29 
 
 		 612 aa  223  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  27.59 
 
 		 588 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 601 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  27.23 
 
 		 606 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  27.38 
 
 		 597 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 615 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.58 
 
 		 602 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>