67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0606 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  100 
 
 		 550 aa  1112    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  52.26 
 
 		 573 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  51.84 
 
 		 807 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  58.38 
 
 		 454 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  45.56 
 
 		 430 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  35.12 
 
 		 602 aa  209  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  46.19 
 
 		 1067 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  38.56 
 
 		 330 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  38.62 
 
 		 651 aa  193  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  43.05 
 
 		 613 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  42.49 
 
 		 879 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.76 
 
 		 757 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  42.93 
 
 		 2495 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  32.29 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  42.71 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 324 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 753 aa  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.33 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  39.59 
 
 		 478 aa  146  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  39.13 
 
 		 750 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  39.41 
 
 		 592 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.45 
 
 		 891 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  42.14 
 
 		 811 aa  136  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  34.02 
 
 		 316 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.22 
 
 		 434 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1557 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  30.79 
 
 		 331 aa  121  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  34.58 
 
 		 817 aa  120  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.83 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  41.8 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0631  bacteriocin  43.33 
 
 		 356 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.420339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.68 
 
 		 377 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  35.93 
 
 		 1131 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  35.93 
 
 		 1131 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  38.22 
 
 		 1732 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  27.4 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.13 
 
 		 697 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  33.9 
 
 		 578 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.34 
 
 		 737 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.25 
 
 		 1527 aa  83.6  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.11 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.47 
 
 		 2821 aa  82  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  27.34 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  46.15 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.48 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  28.33 
 
 		 890 aa  71.6  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  24.72 
 
 		 1363 aa  68.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.88 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  25.94 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  27.22 
 
 		 1475 aa  61.6  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1002 aa  58.9  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3366  hypothetical protein  26.57 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.204348  hitchhiker  0.000467396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  27.16 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1025 aa  57  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1009 aa  56.6  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  26.63 
 
 		 1514 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.1 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 		 399 aa  51.2  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.36 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  25.18 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1094  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.43 
 
 		 399 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000219862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.12 
 
 		 514 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  28.35 
 
 		 184 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.11 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  27.17 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>