More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00830 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  69.13 
 
 
568 aa  775    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  100 
 
 
558 aa  1131    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  61.5 
 
 
542 aa  662    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  71.12 
 
 
553 aa  810    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  58.35 
 
 
551 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  41.28 
 
 
545 aa  388  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  39.45 
 
 
559 aa  366  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  38.9 
 
 
553 aa  364  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  38.9 
 
 
570 aa  359  7e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  38.45 
 
 
551 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  37.88 
 
 
557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  38.53 
 
 
543 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  38.17 
 
 
563 aa  350  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  38.01 
 
 
554 aa  347  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  37.61 
 
 
554 aa  347  4e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  36.81 
 
 
542 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  38.18 
 
 
560 aa  345  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  37.31 
 
 
540 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  36.61 
 
 
558 aa  342  8e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  37.02 
 
 
543 aa  340  5e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  39.19 
 
 
562 aa  337  1.9999999999999998e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  37.2 
 
 
557 aa  337  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  36.5 
 
 
558 aa  335  1e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.53 
 
 
551 aa  335  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  36.26 
 
 
539 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  37.31 
 
 
548 aa  333  5e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  37.76 
 
 
552 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  34.54 
 
 
555 aa  332  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  37.4 
 
 
558 aa  332  8e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  36.12 
 
 
553 aa  332  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  38.33 
 
 
553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  37 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  37.02 
 
 
543 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  38.49 
 
 
560 aa  326  6e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  35.86 
 
 
543 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  37.5 
 
 
550 aa  325  1e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  37.13 
 
 
551 aa  324  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  35.69 
 
 
559 aa  323  7e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  36.62 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  36.45 
 
 
545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  38.36 
 
 
558 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  36.26 
 
 
542 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  37 
 
 
552 aa  317  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  36.05 
 
 
554 aa  317  5e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  35.88 
 
 
542 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  38 
 
 
553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  34.44 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  36.53 
 
 
541 aa  312  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  34.81 
 
 
561 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  36.81 
 
 
536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.03 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  35.73 
 
 
552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  34.44 
 
 
570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.32 
 
 
577 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.48 
 
 
529 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.92 
 
 
530 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.59 
 
 
527 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  33.02 
 
 
532 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  34.69 
 
 
548 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.49 
 
 
555 aa  289  8e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  33.58 
 
 
542 aa  289  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.85 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  33.4 
 
 
547 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.6 
 
 
519 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  33.86 
 
 
500 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  32.33 
 
 
560 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  34 
 
 
525 aa  276  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  32.47 
 
 
563 aa  276  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  34.2 
 
 
523 aa  276  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.22 
 
 
528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.77 
 
 
546 aa  272  9e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  31.62 
 
 
538 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  34.2 
 
 
531 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  33.59 
 
 
553 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  33.59 
 
 
553 aa  269  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  34.6 
 
 
525 aa  266  8.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  34.29 
 
 
535 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  35.07 
 
 
527 aa  257  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  30.42 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  33.4 
 
 
535 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  30.94 
 
 
559 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  33.97 
 
 
533 aa  250  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  33.21 
 
 
528 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.33 
 
 
526 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  32.59 
 
 
541 aa  244  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  29.96 
 
 
527 aa  243  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  30.28 
 
 
529 aa  243  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  30.61 
 
 
527 aa  243  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  31.19 
 
 
536 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  30.97 
 
 
548 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  30 
 
 
550 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  30.94 
 
 
536 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  31.44 
 
 
548 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  28.39 
 
 
552 aa  220  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  28.63 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  30.04 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  27.62 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28177  component of chaperonin-containing T-complex  29.91 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474469  normal  0.235435 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  28.73 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  28.73 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>