More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0058 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0058  flagellar biosynthesis sigma factor  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0099  flagellar biosynthesis sigma factor  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.939044  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0071  flagellar biosynthesis sigma factor  99.13 
 
 
238 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0236  flagellar biosynthesis sigma factor  77.97 
 
 
228 aa  364  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0370  flagellar biosynthesis sigma factor  67.57 
 
 
234 aa  314  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.82906e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1511  flagellar biosynthesis sigma factor  66.67 
 
 
234 aa  303  1e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.805227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1021  flagellar biosynthesis sigma factor  66.67 
 
 
234 aa  301  4e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000131852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0296  RNA polymerase sigma factor, FliA/WhiG family  62.88 
 
 
237 aa  297  7e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000331277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0706  flagellar biosynthesis sigma factor  56.31 
 
 
227 aa  251  8e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2011  sigma 28 (flagella/sporulation)  33.48 
 
 
232 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1404  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.04 
 
 
231 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2939  flagellar biosynthesis sigma factor  32.02 
 
 
240 aa  120  2e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2112  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
239 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1590  flagellar biosynthesis sigma factor  31.65 
 
 
240 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0383  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.19 
 
 
233 aa  119  4e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1287  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
229 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.867666  hitchhiker  0.000600244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1164  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
229 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.072114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2118  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
229 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.81946e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2171  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
229 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000579574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2156  flagellar biosynthesis sigma factor  32.26 
 
 
239 aa  119  5e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2696  flagellar biosynthesis sigma factor  32.26 
 
 
239 aa  119  5e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.099334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1724  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.26 
 
 
239 aa  119  5e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0719948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1717  flagellar biosynthesis sigma factor  32.26 
 
 
239 aa  119  5e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1260  flagellar biosynthesis sigma factor  32.26 
 
 
239 aa  119  5e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2021  flagellar biosynthesis sigma factor  32.26 
 
 
239 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0985  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.06 
 
 
242 aa  117  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2509  flagellar biosynthesis sigma factor  31.67 
 
 
239 aa  116  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1482  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  28.81 
 
 
328 aa  117  2e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124317  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2561  flagellar biosynthesis sigma factor  32.57 
 
 
240 aa  116  2e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1558  flagellar biosynthesis sigma factor  31.19 
 
 
240 aa  117  2e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1118  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  30.84 
 
 
244 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1637  sigma 28  30.67 
 
 
262 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195318  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2011  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  29 
 
 
265 aa  115  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6128  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  30.94 
 
 
244 aa  115  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2027  flagellar biosynthesis sigma factor  30.88 
 
 
240 aa  116  4e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1898  flagellar biosynthesis sigma factor  32.11 
 
 
240 aa  115  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2280  flagellar biosynthesis sigma factor  31.34 
 
 
240 aa  116  4e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2380  flagellar biosynthesis sigma factor  31.34 
 
 
240 aa  116  4e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0477  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.33 
 
 
247 aa  114  1e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.2 
 
 
262 aa  114  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0429  sigma 28 (flagella/sporulation)  30.89 
 
 
250 aa  114  1e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0984  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.63 
 
 
245 aa  114  1e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  6.19324e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1249  RNA polymerase sigma-70 factor  30.54 
 
 
246 aa  113  2e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2934  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  31.7 
 
 
257 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3053  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon  31.15 
 
 
250 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1948  flagellar biosynthesis sigma factor  29.52 
 
 
244 aa  112  4e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0159  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  29.06 
 
 
265 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0325  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.17 
 
 
260 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.473462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2144  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.97 
 
 
246 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000102302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3468  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  27.43 
 
 
267 aa  111  8e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2030  RNA polymerase sigma factor SigD  32.58 
 
 
251 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1180  RNA polymerase sigma-70 factor  28.12 
 
 
236 aa  110  1e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4341  flagellar biosynthesis sigma factor  30.77 
 
 
246 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  0.695948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27870  motility sigma factor 28  30.74 
 
 
231 aa  110  1e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.736516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1526  flagellar biosynthesis sigma factor  30.77 
 
 
246 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733925  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3910  flagellar biosynthesis sigma factor  30.77 
 
 
246 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2025  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.3 
 
 
252 aa  110  2e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0383  sigma-70 factor  31.22 
 
 
227 aa  110  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0747  sigma 28 (flagella/sporulation)  32.34 
 
 
241 aa  110  2e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.592046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3030  flagellar biosynthesis sigma factor  30.38 
 
 
242 aa  109  4e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3037  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  28.88 
 
 
260 aa  108  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1383  flagellar biosynthesis sigma factor  29.91 
 
 
239 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0146638  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09870  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigD/FliA/WhiG  26.92 
 
 
295 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4108  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  31.05 
 
 
251 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5913  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  25.65 
 
 
272 aa  108  7e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00269846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3081  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit  27.35 
 
 
237 aa  108  8e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439211  normal  0.490466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1862  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  29.26 
 
 
247 aa  108  9e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.347265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1975  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  30.04 
 
 
247 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1979  motility sigma factor FliA  31.3 
 
 
246 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3437  flagellar biosynthesis sigma factor  31.3 
 
 
246 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0675365  normal  0.612127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1384  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.61 
 
 
279 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1563  flagellar biosynthesis sigma factor  32.34 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.074099  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2559  flagellar biosynthesis sigma factor  29.96 
 
 
237 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1159  flagellar biosynthesis protein, alternative sigma factor 28  29.79 
 
 
255 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1281  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.04 
 
 
242 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1622  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  26.5 
 
 
238 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00524411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2805  flagellar biosynthesis sigma factor  31.65 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.838536  normal  0.135389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3049  flagellar biosynthesis sigma factor  29.31 
 
 
239 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0797202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3210  flagellar biosynthesis sigma factor  31.91 
 
 
237 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3702  RNA polymerase sigma 28 (sigma F) factor  27.9 
 
 
238 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0322756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3428  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.8 
 
 
245 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2909  flagellar biosynthesis sigma factor  29.79 
 
 
237 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3051  flagellar biosynthesis sigma factor  29.79 
 
 
237 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.120605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2919  flagellar biosynthesis sigma factor  29.79 
 
 
237 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1454  flagellar biosynthesis sigma factor  29.79 
 
 
237 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.375178  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1299  flagellar biosynthesis sigma factor  31.06 
 
 
237 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.178662  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1366  flagellar biosynthesis sigma factor  31.06 
 
 
237 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183792  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1359  flagellar biosynthesis sigma factor  31.06 
 
 
237 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.273626  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1338  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  28.89 
 
 
241 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1378  flagellar biosynthesis sigma factor  30.47 
 
 
239 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1306  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  31.22 
 
 
245 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.152189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3667  flagellar biosynthesis sigma factor  29.91 
 
 
246 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0670648  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1635  flagellar biosynthesis sigma factor  32.13 
 
 
242 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110692  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0757  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  29.78 
 
 
253 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45630  flagellar biosynthesis sigma factor  32.8 
 
 
247 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531213  normal  0.225194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1002  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  28.45 
 
 
283 aa  104  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.814788  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3872  flagellar biosynthesis sigma factor  32.8 
 
 
239 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1175  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  29.29 
 
 
253 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.216131  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1746  flagellar biosynthesis sigma factor  28.63 
 
 
238 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0198  flagellar biosynthesis sigma factor  28.76 
 
 
244 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>