More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1404 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1404  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  100 
 
 
231 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1431  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  44.3 
 
 
226 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0383  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  42.17 
 
 
233 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0025  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  41.96 
 
 
220 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0025  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  42.27 
 
 
214 aa  168  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000417711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1975  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  39.09 
 
 
247 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0134  flagellar biosynthesis sigma factor  33.33 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0058  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3800  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353237  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2843  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.540839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1699  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3374  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300341  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3132  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2836  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0253  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910548  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3840  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3921  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0271  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3419  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27870  motility sigma factor 28  36.89 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.736516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3166  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
243 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2960  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  0.239261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1724  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  38.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0719948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0477  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  37.1 
 
 
247 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2696  flagellar biosynthesis sigma factor  38.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.099334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2156  flagellar biosynthesis sigma factor  38.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0179  flagellar biosynthesis sigma factor  32.89 
 
 
244 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1717  flagellar biosynthesis sigma factor  38.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1260  flagellar biosynthesis sigma factor  38.39 
 
 
239 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45630  flagellar biosynthesis sigma factor  37.72 
 
 
247 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531213  normal  0.225194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3872  flagellar biosynthesis sigma factor  37.72 
 
 
239 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2021  flagellar biosynthesis sigma factor  38.39 
 
 
239 aa  148  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0185  flagellar biosynthesis sigma factor  32.46 
 
 
243 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0198  flagellar biosynthesis sigma factor  32.46 
 
 
244 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.410275  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2934  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  36.4 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3468  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  39.01 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2509  flagellar biosynthesis sigma factor  36.89 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4341  flagellar biosynthesis sigma factor  36.94 
 
 
246 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal  0.695948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1526  flagellar biosynthesis sigma factor  36.94 
 
 
246 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733925  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0985  RNA polymerase, sigma 28 subunit  36.61 
 
 
242 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2388  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  38.86 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2939  flagellar biosynthesis sigma factor  34.96 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1287  flagellar biosynthesis sigma factor  37.05 
 
 
229 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.867666  hitchhiker  0.000600244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2112  flagellar biosynthesis sigma factor  37.05 
 
 
239 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1164  flagellar biosynthesis sigma factor  37.05 
 
 
229 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.072114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2171  flagellar biosynthesis sigma factor  37.05 
 
 
229 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000579574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2118  flagellar biosynthesis sigma factor  37.05 
 
 
229 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000381946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1383  flagellar biosynthesis sigma factor  34.67 
 
 
239 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0146638  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1558  flagellar biosynthesis sigma factor  37.5 
 
 
240 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3910  flagellar biosynthesis sigma factor  36.94 
 
 
246 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3428  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  38.86 
 
 
245 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1002  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  29.87 
 
 
283 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.814788  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2380  flagellar biosynthesis sigma factor  36.28 
 
 
240 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2280  flagellar biosynthesis sigma factor  36.28 
 
 
240 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2805  flagellar biosynthesis sigma factor  35.11 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.838536  normal  0.135389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2561  flagellar biosynthesis sigma factor  38.14 
 
 
240 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1898  flagellar biosynthesis sigma factor  38.14 
 
 
240 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2011  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.38 
 
 
265 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1948  flagellar biosynthesis sigma factor  34.39 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1590  flagellar biosynthesis sigma factor  36.74 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3667  flagellar biosynthesis sigma factor  36.89 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0670648  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1563  flagellar biosynthesis sigma factor  36.49 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.074099  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0794  sigma 28 (flagella/sporulation)  34.05 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0420105  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2011  sigma 28 (flagella/sporulation)  33.19 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3702  RNA polymerase sigma 28 (sigma F) factor  34.62 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0322756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.62 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3994  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.29 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1519  flagellar biosynthesis sigma factor  37.97 
 
 
239 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1378  flagellar biosynthesis sigma factor  36.2 
 
 
239 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1454  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.375178  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2909  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2559  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3051  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.120605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2919  flagellar biosynthesis sigma factor  36.65 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2155  Sigma28 (flagella)  37.44 
 
 
234 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1744  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  35.06 
 
 
257 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1118  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  33.18 
 
 
244 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1979  motility sigma factor FliA  36.04 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3437  flagellar biosynthesis sigma factor  36.04 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0675365  normal  0.612127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0743  sigma-70 region 4  34.65 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09870  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigD/FliA/WhiG  34.35 
 
 
295 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84003  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2027  flagellar biosynthesis sigma factor  35.4 
 
 
240 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3210  flagellar biosynthesis sigma factor  35.29 
 
 
237 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3037  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.17 
 
 
260 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2280  flagellar biosynthesis sigma factor  34.1 
 
 
239 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0133422  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4144  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.04 
 
 
243 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0383  sigma-70 factor  34.53 
 
 
227 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1635  flagellar biosynthesis sigma factor  35.14 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110692  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1313  sigma 28 (flagella/sporulation)  33.63 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3049  flagellar biosynthesis sigma factor  34.84 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0797202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1338  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  32.6 
 
 
241 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4127  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  35 
 
 
248 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000536564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0429  sigma 28 (flagella/sporulation)  34.96 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0159  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.23 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3053  RNA polymerase sigma factor for flagellar operon  35.4 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1390  flagellar biosynthesis sigma factor  34.68 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1180  RNA polymerase sigma-70 factor  31.88 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0747  sigma 28 (flagella/sporulation)  36.99 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.592046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2164  flagellar protein FliS  34.1 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.980839  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0325  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.98 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.473462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>