116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1068 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  775    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 392 aa  196  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 386 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  28.91 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  28.25 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  28.02 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  27 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  27.6 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  25.36 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  25.26 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.54 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  25.88 
 
 		 507 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.57 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  25.44 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  23.44 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.85 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.76 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.12 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.87 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  24.7 
 
 		 474 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  25.87 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  22.07 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  22.07 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  22.07 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  22.07 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  22.99 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  26.9 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  22.07 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  27.07 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  24.64 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  25.14 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  23.35 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.26 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25.99 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  22.38 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.26 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  21.48 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  21.48 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  20.05 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  26.67 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  27.32 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.61 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.5 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  26.52 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  24.92 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  19.8 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  26.49 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  26.72 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  21.29 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  19.3 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  22.34 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.53 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  23.04 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  22.31 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.38 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  25.94 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  25.94 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  23.44 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  24.79 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  24.85 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  19.74 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  22.01 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  23.59 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  22.81 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  25.61 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  21.3 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  25.17 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  22.93 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>