More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1851 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1851  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 355 aa  702    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2055  DNA polymerase III subunit beta  82.82 
 
 		 355 aa  600  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0002  DNA polymerase III subunit beta  64.33 
 
 		 356 aa  441  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0003  DNA polymerase III subunit beta  60.85 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0004  DNA polymerase III, beta subunit  58.03 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000263126  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.39 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0028  DNA polymerase III subunit beta  53.54 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.207832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0002  DNA polymerase III subunit beta  53.54 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.97 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.68 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.99 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.73 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.46 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  26.87 
 
 		 367 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.17 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.14 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.84 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.97 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.78 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.81 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  23.49 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.57 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.17 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.85 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.79 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  27.9 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  25.93 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  29.56 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  29.15 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.09 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.02 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.85 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  23.56 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.71 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.03 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.9 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.99 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.14 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  29 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  22.09 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.01 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.67 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000790466  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  23.77 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.38 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  25.6 
 
 		 382 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.78 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.81 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.81 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.81 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  22.09 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  22.09 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.81 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  22.09 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  22.09 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  24.6 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03584  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000276402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0647653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4066  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0145467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5129  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000402669  normal  0.135624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  25.66 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4224  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000133889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.28 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3914  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000199842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4211  DNA polymerase III subunit beta  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03528  hypothetical protein  21.51 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.53 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.22 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.45 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.22 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  24.24 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  24.86 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.57 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.57 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.38 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1203  DNA polymerase III, beta subunit  27.09 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0971789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.03 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.07 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  28.14 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>