More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0002 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 356 aa  700    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2055  DNA polymerase III subunit beta  67.13 
 
 		 355 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1851  DNA polymerase III subunit beta  64.33 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0003  DNA polymerase III subunit beta  56.5 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0004  DNA polymerase III, beta subunit  55.34 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000263126  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.69 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0028  DNA polymerase III subunit beta  50.85 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.207832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0002  DNA polymerase III subunit beta  50.85 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.12 
 
 		 355 aa  348  6e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.28 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.63 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.72 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  23.45 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.12 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  27.7 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.92 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.43 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.8 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.53 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.13 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.46 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.71 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  22.79 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  22.7 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  24.22 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  23.3 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  22.97 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.14 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.47 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.68 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.47 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  23.16 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.56 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  24.21 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.22 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0002  DNA polymerase III, beta chain  24.86 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3715  DNA polymerase III, beta subunit  23.6 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.48 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.48 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.48 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.78 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  24.85 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.48 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.85 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.27 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.32 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  25.44 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0002  DNA polymerase III, beta chain  24.32 
 
 		 367 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 		 366 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  25.16 
 
 		 366 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  24.04 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0033  DNA polymerase III subunit beta  21.24 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234864  normal  0.233091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.29 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  22.89 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.02 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  24 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.89 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  23.7 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.41 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.47 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.3 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201514  hitchhiker  0.00206466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.19 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.51 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.64 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.74 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.1 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40244  normal  0.672581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  23.68 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.48 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0846842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.97 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.6 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.56 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.89 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  24.56 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.49 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  20.72 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.44 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.79 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000008266  decreased coverage  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  20.72 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  25.18 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  22.34 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>