More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2055 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2055  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 355 aa  703    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1851  DNA polymerase III subunit beta  82.82 
 
 		 355 aa  600  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0002  DNA polymerase III subunit beta  67.13 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0003  DNA polymerase III subunit beta  59.44 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0004  DNA polymerase III, beta subunit  57.75 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000263126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0002  DNA polymerase III subunit beta  55.81 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.39 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0028  DNA polymerase III subunit beta  54.96 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.207832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.39 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.24 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.71 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.42 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  26.89 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.42 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.17 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.17 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.66 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  25.14 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  24.86 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.86 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.71 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.31 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  24.57 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  24 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.45 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000008266  decreased coverage  0.00275233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.22 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.86 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  25.74 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  25.46 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.99 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.86 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.29 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  28.16 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.5 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  24.22 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.2 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.4 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.59 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.76 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.94 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  23.85 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.97 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.65 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.26 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  24.33 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  25.54 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  24.29 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  24.57 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.29 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.57 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.63 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  22.62 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.35 
 
 		 368 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.02 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40244  normal  0.672581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  25.33 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.61 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.8 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  24.06 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0002  DNA polymerase III, beta chain  24.72 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  24.72 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.54 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000101704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.72 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  23.5 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.06 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.8 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  24.59 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.33 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  24.67 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  26.5 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.6 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0002  DNA polymerase III, beta chain  24.51 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.22 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.43 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000790466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.53 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.67 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.67 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1203  DNA polymerase III, beta subunit  26.59 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0971789  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.21 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.29 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>