67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0459 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  100 
 
 		 644 aa  1286    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  57.5 
 
 		 620 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  82.87 
 
 		 637 aa  1015    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  56.37 
 
 		 621 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  54.07 
 
 		 615 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  55.43 
 
 		 621 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  53.96 
 
 		 615 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  53.8 
 
 		 615 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  36.47 
 
 		 955 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.72 
 
 		 950 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  36.02 
 
 		 950 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  35.51 
 
 		 955 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  35.04 
 
 		 958 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  35.04 
 
 		 958 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  35.55 
 
 		 953 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  34.59 
 
 		 797 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.68 
 
 		 953 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  32.89 
 
 		 818 aa  97.4  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  34.44 
 
 		 848 aa  94.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  33.2 
 
 		 746 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  29.41 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  32.86 
 
 		 782 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  29.57 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  32.41 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  31.93 
 
 		 778 aa  77.8  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  27.11 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  34.72 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  31.84 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  27.59 
 
 		 1389 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  26.92 
 
 		 1557 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  25.49 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  29.63 
 
 		 777 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  26.91 
 
 		 338 aa  62  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  27.27 
 
 		 275 aa  62  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  32.37 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  34.65 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  30.29 
 
 		 326 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  32.67 
 
 		 777 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  28.3 
 
 		 736 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  32.89 
 
 		 777 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  29.34 
 
 		 272 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  31.97 
 
 		 777 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  34.29 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6335  hypothetical protein  27.12 
 
 		 208 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  30.71 
 
 		 776 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  26.7 
 
 		 890 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  31.79 
 
 		 775 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  30.63 
 
 		 890 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  28.73 
 
 		 899 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  24.79 
 
 		 1255 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  28.95 
 
 		 354 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  27.5 
 
 		 986 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.33 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  27.59 
 
 		 739 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  29.93 
 
 		 621 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.33 
 
 		 681 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2188  hypothetical protein  29.1 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.67 
 
 		 678 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  29.55 
 
 		 523 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1495 aa  45.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  29.66 
 
 		 357 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  31.08 
 
 		 1287 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  26.12 
 
 		 736 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>