More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1411 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  93.29 
 
 		 295 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  82.97 
 
 		 303 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  75.36 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  76.05 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  76.05 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  75.67 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  75.67 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  75.67 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  75.67 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  75.67 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  71.43 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  67.86 
 
 		 287 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  67.86 
 
 		 287 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  67.77 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  67.4 
 
 		 285 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  67.4 
 
 		 285 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  67.63 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  61.11 
 
 		 280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  60.71 
 
 		 282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  61.11 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  55.94 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  57.63 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  51.34 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  49.43 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  47.49 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  47.58 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  51.28 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  47.33 
 
 		 265 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  52.65 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  47.71 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  50.93 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  46.56 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  44.66 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  50.83 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  50.67 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  46.56 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  50.85 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  44.32 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  42.15 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  40.65 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  45.64 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  44.86 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  45.56 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  43.93 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  46.03 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  43.78 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  42.97 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  44.22 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  48.5 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  48.48 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  44.44 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  46.85 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  37.15 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  39.04 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  44.22 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  48.52 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  37.15 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  45.91 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  43.37 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  40.66 
 
 		 296 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  41.61 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  43.02 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  44.84 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  36.4 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  46.54 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  39.92 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.74 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  35.68 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  39.1 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  34.77 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  36.96 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.97 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.36 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  36.96 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  33.86 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  38.78 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  38.32 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4709  glutamate racemase  38.07 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000583223  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.74 
 
 		 276 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  35.56 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  39.46 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  40.86 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  40.86 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  33.92 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  38.86 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  39.42 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000357145  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  39.37 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  36.44 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  33.6 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  37.55 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  39.46 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  39.02 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  37.65 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34.25 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  38.98 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  40.47 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  31.58 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  31.58 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  38.7 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>