153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0607 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 408 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  92.63 
 
 		 408 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  68.06 
 
 		 412 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  62.65 
 
 		 411 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  65.4 
 
 		 412 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.3 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  64.84 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  55.22 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  52.88 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0756  PepSY-associated TM helix  42.62 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3317  PepSY-associated TM helix domain protein  45.39 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00586385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0433  PepSY-associated TM helix domain protein  43.38 
 
 		 433 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2382  PepSY-associated TM helix  44.42 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.964791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.03 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  42.55 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5317  PepSY-associated TM helix domain protein  41.27 
 
 		 430 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  40.69 
 
 		 392 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  39.34 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32750  hypothetical protein  38.78 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196352  hitchhiker  0.0000232684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1822  hypothetical protein  35.66 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  28.5 
 
 		 393 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  29.77 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  30.73 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1511  hypothetical protein  25.34 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  26.44 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  24.94 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.19 
 
 		 840 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.12 
 
 		 360 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  25 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  24.7 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  24.08 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.11 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  27.54 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.84 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  27.72 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  25.65 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.88 
 
 		 849 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.84 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  24.94 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2341  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.42 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  23.1 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.45 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2134  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.674924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  25.6 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.49 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.11 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.64 
 
 		 850 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.56 
 
 		 851 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.5 
 
 		 842 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  27.03 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  21.55 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  21.08 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.1 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.23 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  20.97 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  22.42 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.13 
 
 		 850 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  23.51 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.73 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.03 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  22.28 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.65 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.27 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  23.47 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  24.15 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  22.66 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  22.28 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.67 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.32 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.34 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  23.57 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.9 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  23.85 
 
 		 822 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  19.75 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  25 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.22 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.37 
 
 		 850 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.41 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.66 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  21.92 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  22.17 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.76 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.39 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  25.72 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.8 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  21.69 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  26.01 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.44 
 
 		 840 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  20.84 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15080  hypothetical protein  25.12 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.43 
 
 		 844 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  19.75 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1117 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.06 
 
 		 885 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.13 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>