More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1824 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
210 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
217 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  28.82 
 
 
197 aa  98.6  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.52 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  35.6 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.06 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.98 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.7 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.26 
 
 
442 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.5 
 
 
443 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.21 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.21 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.18 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.18 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.94 
 
 
442 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  30.86 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.65 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  24.77 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.75 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  24.55 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  36.79 
 
 
438 aa  65.5  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  31.01 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  23.85 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  28.09 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  27.65 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.91 
 
 
444 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 
459 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.54 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 
220 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
223 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
235 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  26.75 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>