More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6742 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1564  porin  94.4 
 
 		 357 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  100 
 
 		 357 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  94.4 
 
 		 357 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  82.91 
 
 		 357 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  82.91 
 
 		 357 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  50.44 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  52.09 
 
 		 340 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  40 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  39.76 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  39.39 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  39.46 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  40.66 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  37.85 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  39.94 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  40.06 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  40.06 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  38.25 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.65 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.08 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  39.57 
 
 		 342 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  36.69 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  37.08 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  36.53 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  37.72 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  37.39 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  35.92 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  37.39 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  38.51 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  36.53 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  40.88 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  38.21 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  37.8 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  37.5 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  36.44 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  37.5 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  37.5 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  37.5 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  35.49 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  36.61 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  36.9 
 
 		 358 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.78 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  32.45 
 
 		 523 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.16 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  31.13 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  32.77 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  32.77 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.82 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30.52 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  32.49 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.43 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  33.33 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.2 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  33.33 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  33.33 
 
 		 384 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  33.04 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.78 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.06 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  28.83 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  31.79 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  31.79 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  28.76 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.86 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  28.28 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  31.79 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  32.33 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  30.66 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  31.82 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  30.66 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.27 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  30.21 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  27.61 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28.02 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  27.61 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  27.61 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.72 
 
 		 436 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  29.22 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  32.43 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  32.01 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.04 
 
 		 449 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  29.78 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  29.78 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.13 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.13 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.13 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.13 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.13 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  30 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  29.78 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.27 
 
 		 355 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  30.97 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  30.71 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  38.42 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  30.71 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.12 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0189  porin Gram-negative type  32.23 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615373  hitchhiker  0.00390966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  34.03 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>