More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3068 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  97.82 
 
 
367 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  97.55 
 
 
367 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  99.46 
 
 
367 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  94.82 
 
 
367 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4660  ABC transporter related  97.28 
 
 
367 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960037  normal  0.0689846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.32 
 
 
365 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  85.32 
 
 
365 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.32 
 
 
365 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.32 
 
 
365 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  85.32 
 
 
365 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  86.05 
 
 
337 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  86.05 
 
 
337 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  85.76 
 
 
337 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  77.41 
 
 
366 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4790  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  76.58 
 
 
366 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165065  hitchhiker  0.0000108781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  74.93 
 
 
367 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 
372 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 
366 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 
376 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.09 
 
 
352 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
353 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
353 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  43.54 
 
 
351 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.12 
 
 
353 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  40.9 
 
 
323 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  42.07 
 
 
353 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.89 
 
 
371 aa  255  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.23 
 
 
362 aa  253  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.99 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.48 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  41.99 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  41.99 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
366 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 
333 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.26 
 
 
371 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.99 
 
 
369 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.18 
 
 
372 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.51 
 
 
333 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.46 
 
 
360 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
333 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  41.71 
 
 
369 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.13 
 
 
373 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
408 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.6 
 
 
380 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41 
 
 
359 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.35 
 
 
353 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.88 
 
 
372 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  39.4 
 
 
323 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2369  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.46 
 
 
373 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
367 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
355 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  46.1 
 
 
339 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 
333 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.68 
 
 
366 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
357 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  43.65 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  38.99 
 
 
329 aa  246  6e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.67 
 
 
381 aa  245  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.32 
 
 
352 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.59 
 
 
364 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.93 
 
 
354 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 
367 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.59 
 
 
364 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.32 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  51.67 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  43.51 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  43.51 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.84 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.23 
 
 
360 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 
358 aa  243  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  41.6 
 
 
362 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.82 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.48 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.48 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 
353 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.98 
 
 
368 aa  242  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  43.09 
 
 
363 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  43.51 
 
 
360 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.98 
 
 
370 aa  243  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  43.51 
 
 
360 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.27 
 
 
328 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.49 
 
 
370 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  41.5 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 
342 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 
358 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.17 
 
 
378 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.61 
 
 
384 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.25 
 
 
426 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>